KASUS INFEKSI ALAMI: DIAGNOSA STREPTOCOCCUS AGALACTIAE DARI JARINGAN IKAN NILA (Oreochromis niloticus) MENGGUNAKAN POLYMERASE CHAIN REACTION

Abstract

Streptococcus agalactiae merupakan salah satu bakteri penyebab streptococcosis pada ikan nila (Oreochromis niloticus). Pada pertengahan tahun 2010, telah terjadi kasus kematian dengan tingkat mortalitas tinggi pada budidaya ikan nila di tambak bersalinitas rendah di Karawang-Jawa Barat. Diagnosa agen penyebab penyakit tersebut dilakukan dengan teknik Polymerase Chain Reaction dengan menggunakan pasangan primer spesifik Sdi252 dan Sdi61. Umumnya, identifikasi pathogen (bakteri) dengan teknik PCR dilakukan dengan menggunakan koloni bakteri sebagai bahan ekstraksi. Namun pada penelitian ini dilakukan isolasi DNA langsung dari jaringan ikan yang menunjukkan gejala terinfeksi bakteri tersebut. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapat informasi berupa jenis organ target S.agalactiae yang dapat digunakan dalam proses ekstraksi DNA bakteri. Sampel ikan sebanyak 3 ekor diambil jaringannya (otak, hati, limfa, dan ginjal) untuk diekstraksi dengan metoda pemanasan. Pita positif pada 192 bp diperoleh dari otak (2/3), hati (2/3), limfa (3/3) dan ginjal (2/2). Sebagai kontrol digunakan isolat bakteri dari masing-masing otak ikan sampel. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ke-4 organ dapat digunakan sebagai sumber DNA untuk identifikasi bakteri S.agalactiae, namun limfa yang menunjukkan hasil yang paling konsisten pada ke-3 ikan sampel.