Karakterisasi Tanaman Keladi Hias ( Caladium  Spp.) berdasarkan Penanda Molekuler RAPD

Asep Rinal Supratman; Aziz Purwantoro

doi:10.22146/veg.37168

Karakterisasi Tanaman Keladi Hias (Caladium Spp.) berdasarkan Penanda Molekuler RAPD

https://doi.org/10.22146/veg.37168

Asep Rinal Supratman⁽¹⁾, Aziz Purwantoro^(2*)

(1) Departemen Budidaya Pertanian, Fakultas Pertanian, Universitas Gadjah Mada
(2) Departemen Budidaya Pertanian, Fakultas Pertanian, Universitas Gadjah Mada
(*) Corresponding Author

Abstract

Penelitian dengan judul Karakterisasi Tanaman Keladi Hias (Caladium spp) Berdasarkan Penanda Molekuler RAPD dilaksanakan pada bulan Oktober 2017 hingga Maret 2018 di Ruang Mendel, Laboratorium Pemuliaan Tanaman, Departemen Budidaya Pertanian, Fakultas Pertanian, Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta. Sebanyak 30 tanaman dari empat negara dianalisis dalam penelitian ini yang meliputi 15 Keladi Hias Thailand, 4 Keladi Hias Florida, 2 Keladi Hias Malaysia, 9 Keladi Hias Indonesia, dan Alocasia sebagai pembanding. Pengelompokan keladi hias dan Alocasia berdasarkan penanda molekuler, dibagi menjadi 2 kelompok besar yaitu kelompok A seluruh anggotanya merupakan keladi hias yang mengelompok sesuai dengan daerah diambilnya sampel, dan grup B yang terdiri dari Alocasia. Persentase variasi antar populasi lebih kecil sebesar 23% dibanding dengan nilai variasi dalam populasi sebesar 77% yang menandakan bahwa di dalam populasi keragamannya jauh lebih besar dibanding antar populasi. Keladi hias antar populasi tidak jauh berbeda dibuktikan dengan kecilnya persentase variasi antar populasinya sebesar 23%.

Keywords

karakterisasi; keladi hias; molekuler; RAPD

Full Text:

PDF

References

Bermawie, N. 2005. Karakterisasi Plasma Nutfah Tanaman. Buku Pedoman Pengelolaan Plasma Nutfah Perkebunan. Pusat penelitian dan Pengembangan Perkebunan, Bogor. Hal: 38-52.

Cao, Z., S. Sui., X. Cai., Q. Yang., Z. Deng. 2016. Somaclonal variation in Red Flash Caladium; morphological, cytological and molecular characteri-zation. Plant Cell Tiss Organt Cult., 126: 269–279.

Deng, Z., B.K. Harbaugh, R.O. Kelly, T. Seijo, R.J. McGovern, 2005b. Screening for resistance to pythium root rot among twenty-three Caladium cultivars. Hort Technology, 15: 631-634.

Doyle, J.J and J.L Doyle. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12: 13-15.

Graf, A.B. 1970. Exotica (Roehrs, East Rutherford, N.J), 3rd ed.

Hu, Y., X. Xie., L. Wang., H. Zhang., J. Yang and Y. Li. 2014. Genetic variation in cultivated rheum tanguticum popula-tions. Genetic and mol. Bio. 37(3): 540-548.

Holms, L. L., J. Hendry, L. Tubbs. A. L. Hall, and D. Dittmar. 1965. Caladium Bulbs, Highlands County DARE Rep. 11 pp. 8.

Jena, S.N., S. Verma, K.N. Nair., A.K. srivastava, S. misra, and T.S. Rana. 2014. Genetic diversity and population structure of the mangrove lime (Merope angulate) in india revealed by AFLP and ISSR markers. Aquatic botany, 120: 260-267.

Johari, S., E. Kurnianto., Sutopo, and S. Aminah. 2007. Keragaman protein darah sebagai parameter biogenetic pada sapi jawa. Journal Indonesian tropical agriculture, Hal: 112-118.

Joshi, T., C. Jefrrey., B. Nickolai., Alexandro., D. Xu. 2004. Genome scale gene function prediction using multiple sources of high-throughput data in yeast Saccharomyces cerevisiae. OMICS, 8(4): 322-33.

Loh, J.P., R. Kiew., A. Hay., A. Kee., L.H. Gan., Y.Y. Gan. 2000. Intergeneric and interspecific relationships in Araceae tribe Caladiae and development of molecular markers using amplified fragment length polymorphism (AFLP). Annals of Botany, 85: 371-378.

McGregor, C.E., C.A., Lambert, M.M., Greyling, J.H., Louw and L., Warnich. 2000. A comparative assessment of DNA fingerprinting techniques (RAPD, ISSR, AFLP and SSR) in tetraploid potato (Solanum tuberosum L.) germplasm. Euphytica, 113: 135-144.

Mondini, L., A. Noorani, and M.A. Pagnotta. 2009. Assessing Plant Genetic Diversity by Molecular Tools. Diversity, 1: 19-35.

Nei, M. 1987. Molecular evolutionary genetics. Columbia university press. New york: 175-208.

Pabendon, M.B., M. Azrai, F. Kasim, dan M. J. Wijaya. 2007. Prospek Penggunaan Markah Molekuler dalam Program Pemuliaan Jagung. Pusat Penelitian dan Pengembangan Tanaman Pangan. Balitsereal. Indonesia.

Pereira D.A., R.X. Correa and A.C. Oliveira. 2015. Molecular genetic diversity and differentiation of populations of ‘somnus’ passion fruit trees (Passiflora setacea DC): implications for conservation and ppre-breeding. Biochemical systematics and ecology, 59: 12-21.

Radford A.E., Dickison W.C., Massey J.R., Bell R. 1974. Vascular Plant Systematics. New York (US): Harper & Row.

Sari, V.K. 2015. Keragaman sawo (Manilkara zapota (L) van royen) di daerah istimewa Yogyakarta berdasarkan sifat genetik dan fisikomia buah. Tesis-Universitas Gadjah Mada. Yogyakarta.

Tingey, S.V., J.A. Rafalski, and M.K. Hanafey. 1994. Genetic analysis with RAPD markers. In: Coruzzi, C. and P. Puidormenech (eds.). Plant Molecular Biology. Belin: Springer-Verlag.

Tjitrosoepomo G. 2009. Morfologi Tumbuhan. Yogyakarta (ID): UGM Pr. Hal: 4119.

Vicente, M.C., C. Lopez, La Molina and T. Fulton. 2003. Genetic diversity analysis with molecular marker data: learning module. IPGRI and Cornell University.

Wilfret, G.J., 1983. Tuber production of Caladium cultivars grown in a sandy soil. Proc. Fla. State Hort. Soc., 96: 245-248.

William, J.G.K., A.R. Kubelik, K.J. Livak, J.A. Rafalski, and S.V. Tingey. 1990. DNA Polymorphism Amplified by arbitrary Primers are useful as genetic marker. Nucleic Acids Research, 18: 6531-6535.

Xu, Yunbi. 2010. Molecular Plant Breeding. CABI, United Kingdom.

Zulfahmi. 2013. Penanda DNA untuk analisis genetik tanaman. Jurnal Agrotekno-logi, 3(2): 41-52.

DOI: https://doi.org/10.22146/veg.37168